棒や円(グラフの種類に応じて)などプロット要素に割り当てられている色を変更するには、Paletteプロパティをいずれかの所定のカラーパレットに変更する、または以下のように、カスタムのパレットを作成することができます。
Brush[] customBrushes = new Brush[2] { Brushes.Blue, Brushes.Orange }; c1Chart1.CustomPalette = customBrushes;